2011款相比前两款也没有太大的改变,主要外观上略做修改。同年开始7段式TC,不过并没有出现在2011款车上.


2012年YZF-R1追加来自MgoGP赛车技术的七段式可调尾轮牵引力控制系统。这套顶尖TC(traction control),以及全新的ECU设定。细节也有大幅度更新,新R1的车头变得更尖更破风更有野心,还有LED位置角灯,消声器末端和隔热板经过重新设计。还有全新的上眼镜,设计来自YZR-M1。 表板内建traction control设定显示、追加死火灯、脚踏也经过改良,能增加长靴的接触面,提升人车之间的沟通。
同时推出五十周年特别版
为庆祝Yamaha参战世界格兰披治赛车活动长达五十年,新R1也有珍珠白配火红色的50周年特别版。特别版只做两千台,油缸上嵌有五十周年纪念章和出世编号,全车采用Yamaha金章,随车更附送一套小贴纸。